Il controller intel su z97 ha un massimo di 6 porte sata, per ottenere più porte aggiungono controller extra (asmedia) però le performance non sono al pari di intel e comunque garantiscono la piena compatibilità.
Il firmware di Intel è più aggiornato rispetto a quello asmedia nel tuo bios (versione 1.30) è per quello che ti ho chiesto quella prova.
Altra prova da fare è provare ad accendere il sistema con solo il WD red collegato alla porta 1 e verificare che il bios non dia più l'errore A2, altrimenti provare a sostituire il cavo sata.
In estremis posso prepararti un bios con firmware aggiornati, ma penso che il problema sia proprio l'HD difettato.